Фамилия образована из двух частей, это «Онищ» и «енко».
«Онищ» вероятнее всего происходит от имени Оня, производная форма более 20-ти имен, как мужских так и женских: Семен, Онисий, Флегонт, Иона, Леонтий и др. В 'Ономастиконе' Веселовского. Онищины, 1525 г., Каргополь
Окончание «енко» являются распространённой среди украинцев. Самые ранние упоминания относятся в XVI веку и локализуются преимущественно Подольем. В XVII веке (по документам реестра 1649) они получают широкое распространение среди казаков Левобережья Днепра. Часто фамилии с окончанием -енко брали молодые казаки, чьи отцы имели прозвища без этого окончания: Угрин Старый и Иван Угриненко (то есть Угрин и его сын Иван)[2]. К настоящему времени данный тип фамилий распространился на Беларусь (напр. Лукашенко) и Россию (напр. Матвиенко, Кириенко).
Онищенко, Екатерина Владимировна (род. 1978) — член Правительства Республики Абхазия; с 31 октября 2011 года — министр юстиции Абхазии.
Онищенко, Ирина Владимировна (род. 1975) — мастер спорта России международного класса (спортивное ориентирование на лыжах), двукратный чемпион мира, двукратный чемпион Европы.